Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cul7Q8VE73 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cul7Q8VE73 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Cul7Q8VE73 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cul7Q8VE73 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cul7Q8VE73 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Cul7Q8VE73 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cul7Q8VE73 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cul7Q8VE73 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cul7Q8VE73 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cul7Q8VE73 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cul7Q8VE73 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cul7Q8VE73 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cul7Q8VE73 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cul7Q8VE73 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cul7Q8VE73 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cul7Q8VE73 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cul7Q8VE73 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cul7Q8VE73 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cul7Q8VE73 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cul7Q8VE73 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cul7Q8VE73 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cul7Q8VE73 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Cul7Q8VE73 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cul7Q8VE73 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cul7Q8VE73 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cul7Q8VE73 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cul7Q8VE73 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cul7Q8VE73 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cul7Q8VE73 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cul7Q8VE73 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cul7Q8VE73 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cul7Q8VE73 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cul7Q8VE73 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cul7Q8VE73 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cul7Q8VE73 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cul7Q8VE73 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Cul7Q8VE73 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cul7Q8VE73 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cul7Q8VE73 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cul7Q8VE73 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Cul7Q8VE73 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Cul7Q8VE73 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cul7Q8VE73 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cul7Q8VE73 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cul7Q8VE73 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cul7Q8VE73 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cul7Q8VE73 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Cul7Q8VE73 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cul7Q8VE73 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cul7Q8VE73 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cul7Q8VE73 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cul7Q8VE73 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Cul7Q8VE73 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Cul7Q8VE73 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cul7Q8VE73 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Cul7Q8VE73 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cul7Q8VE73 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cul7Q8VE73 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cul7Q8VE73 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cul7Q8VE73 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cul7Q8VE73 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cul7Q8VE73 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cul7Q8VE73 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cul7Q8VE73 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cul7Q8VE73 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cul7Q8VE73 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cul7Q8VE73 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cul7Q8VE73 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cul7Q8VE73 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cul7Q8VE73 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cul7Q8VE73 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cul7Q8VE73 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cul7Q8VE73 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cul7Q8VE73 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cul7Q8VE73 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Cul7Q8VE73 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Cul7Q8VE73 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Cul7Q8VE73 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cul7Q8VE73 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cul7Q8VE73 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cul7Q8VE73 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cul7Q8VE73 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cul7Q8VE73 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Cul7Q8VE73 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cul7Q8VE73 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cul7Q8VE73 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cul7Q8VE73 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cul7Q8VE73 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cul7Q8VE73 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Cul7Q8VE73 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Cul7Q8VE73 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Cul7Q8VE73 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cul7Q8VE73 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cul7Q8VE73 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Cul7Q8VE73 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cul7Q8VE73 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cul7Q8VE73 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cul7Q8VE73 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cul7Q8VE73 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms