Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE4

Uncharacterized protein C9orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VCE4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8VCE4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8VCE4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8VCE4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8VCE4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8VCE4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8VCE4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8VCE4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8VCE4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8VCE4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8VCE4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8VCE4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8VCE4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8VCE4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8VCE4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8VCE4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8VCE4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8VCE4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8VCE4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms