Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC31

Ccdc9, Coiled-coil domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9Q8VC31 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc9Q8VC31 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc9Q8VC31 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc9Q8VC31 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc9Q8VC31 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc9Q8VC31 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc9Q8VC31 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc9Q8VC31 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc9Q8VC31 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc9Q8VC31 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc9Q8VC31 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc9Q8VC31 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc9Q8VC31 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc9Q8VC31 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc9Q8VC31 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc9Q8VC31 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc9Q8VC31 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc9Q8VC31 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc9Q8VC31 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc9Q8VC31 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc9Q8VC31 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc9Q8VC31 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc9Q8VC31 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc9Q8VC31 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc9Q8VC31 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc9Q8VC31 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc9Q8VC31 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc9Q8VC31 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc9Q8VC31 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc9Q8VC31 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc9Q8VC31 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc9Q8VC31 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc9Q8VC31 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc9Q8VC31 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc9Q8VC31 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc9Q8VC31 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc9Q8VC31 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc9Q8VC31 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc9Q8VC31 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc9Q8VC31 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc9Q8VC31 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc9Q8VC31 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc9Q8VC31 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc9Q8VC31 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc9Q8VC31 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc9Q8VC31 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc9Q8VC31 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc9Q8VC31 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc9Q8VC31 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc9Q8VC31 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc9Q8VC31 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc9Q8VC31 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc9Q8VC31 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc9Q8VC31 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc9Q8VC31 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc9Q8VC31 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc9Q8VC31 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc9Q8VC31 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc9Q8VC31 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc9Q8VC31 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc9Q8VC31 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc9Q8VC31 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms