Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4K2

Irak4, Interleukin-1 receptor-associated kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irak4Q8R4K2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irak4Q8R4K2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irak4Q8R4K2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irak4Q8R4K2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irak4Q8R4K2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irak4Q8R4K2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irak4Q8R4K2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irak4Q8R4K2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irak4Q8R4K2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irak4Q8R4K2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irak4Q8R4K2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irak4Q8R4K2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irak4Q8R4K2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irak4Q8R4K2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irak4Q8R4K2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Irak4Q8R4K2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irak4Q8R4K2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irak4Q8R4K2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irak4Q8R4K2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irak4Q8R4K2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irak4Q8R4K2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irak4Q8R4K2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irak4Q8R4K2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irak4Q8R4K2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irak4Q8R4K2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irak4Q8R4K2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irak4Q8R4K2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irak4Q8R4K2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irak4Q8R4K2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irak4Q8R4K2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irak4Q8R4K2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irak4Q8R4K2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irak4Q8R4K2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Irak4Q8R4K2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irak4Q8R4K2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irak4Q8R4K2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irak4Q8R4K2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Irak4Q8R4K2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irak4Q8R4K2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irak4Q8R4K2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irak4Q8R4K2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irak4Q8R4K2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irak4Q8R4K2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irak4Q8R4K2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irak4Q8R4K2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irak4Q8R4K2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irak4Q8R4K2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Irak4Q8R4K2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irak4Q8R4K2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irak4Q8R4K2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irak4Q8R4K2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irak4Q8R4K2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irak4Q8R4K2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irak4Q8R4K2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Irak4Q8R4K2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Irak4Q8R4K2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irak4Q8R4K2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Irak4Q8R4K2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irak4Q8R4K2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irak4Q8R4K2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Irak4Q8R4K2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irak4Q8R4K2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irak4Q8R4K2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irak4Q8R4K2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irak4Q8R4K2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irak4Q8R4K2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irak4Q8R4K2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Irak4Q8R4K2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irak4Q8R4K2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irak4Q8R4K2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irak4Q8R4K2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irak4Q8R4K2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irak4Q8R4K2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irak4Q8R4K2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irak4Q8R4K2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irak4Q8R4K2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irak4Q8R4K2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irak4Q8R4K2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irak4Q8R4K2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irak4Q8R4K2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irak4Q8R4K2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irak4Q8R4K2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irak4Q8R4K2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irak4Q8R4K2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irak4Q8R4K2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irak4Q8R4K2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irak4Q8R4K2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irak4Q8R4K2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irak4Q8R4K2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irak4Q8R4K2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irak4Q8R4K2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irak4Q8R4K2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irak4Q8R4K2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irak4Q8R4K2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irak4Q8R4K2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irak4Q8R4K2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irak4Q8R4K2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irak4Q8R4K2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irak4Q8R4K2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irak4Q8R4K2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms