Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3L8

Cdk8, Cyclin-dependent kinase 8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk8Q8R3L8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdk8Q8R3L8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdk8Q8R3L8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdk8Q8R3L8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdk8Q8R3L8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdk8Q8R3L8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdk8Q8R3L8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdk8Q8R3L8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdk8Q8R3L8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdk8Q8R3L8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdk8Q8R3L8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdk8Q8R3L8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdk8Q8R3L8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdk8Q8R3L8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdk8Q8R3L8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdk8Q8R3L8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdk8Q8R3L8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdk8Q8R3L8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdk8Q8R3L8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdk8Q8R3L8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdk8Q8R3L8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdk8Q8R3L8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdk8Q8R3L8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdk8Q8R3L8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdk8Q8R3L8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdk8Q8R3L8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdk8Q8R3L8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdk8Q8R3L8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdk8Q8R3L8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdk8Q8R3L8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdk8Q8R3L8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdk8Q8R3L8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdk8Q8R3L8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdk8Q8R3L8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdk8Q8R3L8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdk8Q8R3L8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdk8Q8R3L8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdk8Q8R3L8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdk8Q8R3L8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdk8Q8R3L8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdk8Q8R3L8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdk8Q8R3L8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdk8Q8R3L8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdk8Q8R3L8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdk8Q8R3L8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdk8Q8R3L8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdk8Q8R3L8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdk8Q8R3L8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdk8Q8R3L8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdk8Q8R3L8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdk8Q8R3L8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cdk8Q8R3L8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdk8Q8R3L8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdk8Q8R3L8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdk8Q8R3L8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdk8Q8R3L8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdk8Q8R3L8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdk8Q8R3L8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdk8Q8R3L8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdk8Q8R3L8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdk8Q8R3L8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdk8Q8R3L8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdk8Q8R3L8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdk8Q8R3L8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdk8Q8R3L8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdk8Q8R3L8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdk8Q8R3L8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdk8Q8R3L8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdk8Q8R3L8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdk8Q8R3L8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdk8Q8R3L8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdk8Q8R3L8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdk8Q8R3L8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdk8Q8R3L8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdk8Q8R3L8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdk8Q8R3L8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdk8Q8R3L8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdk8Q8R3L8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdk8Q8R3L8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdk8Q8R3L8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdk8Q8R3L8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdk8Q8R3L8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdk8Q8R3L8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdk8Q8R3L8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdk8Q8R3L8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdk8Q8R3L8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdk8Q8R3L8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdk8Q8R3L8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdk8Q8R3L8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdk8Q8R3L8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdk8Q8R3L8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdk8Q8R3L8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdk8Q8R3L8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdk8Q8R3L8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdk8Q8R3L8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdk8Q8R3L8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdk8Q8R3L8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdk8Q8R3L8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdk8Q8R3L8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdk8Q8R3L8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms