Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms