Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5C8

Rdh9, Cis-retinol/androgen dehydrogenase type 3, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh9Q8K5C8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rdh9Q8K5C8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rdh9Q8K5C8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdh9Q8K5C8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rdh9Q8K5C8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms