Protein–RNA interactions for Protein: Q8K558

Treml1, Trem-like transcript 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml1Q8K558 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Treml1Q8K558 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Treml1Q8K558 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Treml1Q8K558 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Treml1Q8K558 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Treml1Q8K558 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Treml1Q8K558 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Treml1Q8K558 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Treml1Q8K558 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Treml1Q8K558 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Treml1Q8K558 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Treml1Q8K558 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Treml1Q8K558 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Treml1Q8K558 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Treml1Q8K558 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Treml1Q8K558 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Treml1Q8K558 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Treml1Q8K558 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Treml1Q8K558 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Treml1Q8K558 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Treml1Q8K558 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Treml1Q8K558 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Treml1Q8K558 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Treml1Q8K558 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Treml1Q8K558 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Treml1Q8K558 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Treml1Q8K558 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Treml1Q8K558 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Treml1Q8K558 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Treml1Q8K558 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Treml1Q8K558 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Treml1Q8K558 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Treml1Q8K558 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Treml1Q8K558 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Treml1Q8K558 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Treml1Q8K558 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Treml1Q8K558 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Treml1Q8K558 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Treml1Q8K558 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Treml1Q8K558 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Treml1Q8K558 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Treml1Q8K558 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Treml1Q8K558 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Treml1Q8K558 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Treml1Q8K558 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Treml1Q8K558 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Treml1Q8K558 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Treml1Q8K558 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Treml1Q8K558 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Treml1Q8K558 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Treml1Q8K558 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Treml1Q8K558 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Treml1Q8K558 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Treml1Q8K558 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Treml1Q8K558 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Treml1Q8K558 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Treml1Q8K558 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Treml1Q8K558 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Treml1Q8K558 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Treml1Q8K558 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Treml1Q8K558 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Treml1Q8K558 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Treml1Q8K558 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Treml1Q8K558 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Treml1Q8K558 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Treml1Q8K558 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Treml1Q8K558 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Treml1Q8K558 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Treml1Q8K558 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Treml1Q8K558 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Treml1Q8K558 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms