Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vrk3Q8K3G5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vrk3Q8K3G5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vrk3Q8K3G5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vrk3Q8K3G5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vrk3Q8K3G5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vrk3Q8K3G5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vrk3Q8K3G5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vrk3Q8K3G5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vrk3Q8K3G5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vrk3Q8K3G5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vrk3Q8K3G5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vrk3Q8K3G5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vrk3Q8K3G5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vrk3Q8K3G5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vrk3Q8K3G5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vrk3Q8K3G5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vrk3Q8K3G5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vrk3Q8K3G5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vrk3Q8K3G5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vrk3Q8K3G5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vrk3Q8K3G5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vrk3Q8K3G5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vrk3Q8K3G5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vrk3Q8K3G5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vrk3Q8K3G5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vrk3Q8K3G5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vrk3Q8K3G5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vrk3Q8K3G5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vrk3Q8K3G5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vrk3Q8K3G5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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