Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdk5rap2Q8K389 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdk5rap2Q8K389 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdk5rap2Q8K389 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdk5rap2Q8K389 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdk5rap2Q8K389 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdk5rap2Q8K389 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdk5rap2Q8K389 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdk5rap2Q8K389 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdk5rap2Q8K389 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdk5rap2Q8K389 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdk5rap2Q8K389 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdk5rap2Q8K389 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdk5rap2Q8K389 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdk5rap2Q8K389 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdk5rap2Q8K389 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdk5rap2Q8K389 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdk5rap2Q8K389 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdk5rap2Q8K389 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cdk5rap2Q8K389 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cdk5rap2Q8K389 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cdk5rap2Q8K389 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cdk5rap2Q8K389 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cdk5rap2Q8K389 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cdk5rap2Q8K389 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cdk5rap2Q8K389 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cdk5rap2Q8K389 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cdk5rap2Q8K389 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cdk5rap2Q8K389 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cdk5rap2Q8K389 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cdk5rap2Q8K389 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cdk5rap2Q8K389 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cdk5rap2Q8K389 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cdk5rap2Q8K389 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Cdk5rap2Q8K389 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdk5rap2Q8K389 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdk5rap2Q8K389 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdk5rap2Q8K389 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdk5rap2Q8K389 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdk5rap2Q8K389 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdk5rap2Q8K389 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdk5rap2Q8K389 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdk5rap2Q8K389 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdk5rap2Q8K389 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdk5rap2Q8K389 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdk5rap2Q8K389 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdk5rap2Q8K389 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdk5rap2Q8K389 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdk5rap2Q8K389 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdk5rap2Q8K389 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdk5rap2Q8K389 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdk5rap2Q8K389 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdk5rap2Q8K389 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdk5rap2Q8K389 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdk5rap2Q8K389 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdk5rap2Q8K389 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdk5rap2Q8K389 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdk5rap2Q8K389 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdk5rap2Q8K389 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdk5rap2Q8K389 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdk5rap2Q8K389 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdk5rap2Q8K389 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdk5rap2Q8K389 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdk5rap2Q8K389 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdk5rap2Q8K389 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdk5rap2Q8K389 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdk5rap2Q8K389 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdk5rap2Q8K389 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdk5rap2Q8K389 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdk5rap2Q8K389 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdk5rap2Q8K389 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdk5rap2Q8K389 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdk5rap2Q8K389 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cdk5rap2Q8K389 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Cdk5rap2Q8K389 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cdk5rap2Q8K389 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Cdk5rap2Q8K389 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cdk5rap2Q8K389 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cdk5rap2Q8K389 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdk5rap2Q8K389 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdk5rap2Q8K389 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdk5rap2Q8K389 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdk5rap2Q8K389 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdk5rap2Q8K389 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdk5rap2Q8K389 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdk5rap2Q8K389 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdk5rap2Q8K389 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdk5rap2Q8K389 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdk5rap2Q8K389 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdk5rap2Q8K389 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdk5rap2Q8K389 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdk5rap2Q8K389 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdk5rap2Q8K389 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdk5rap2Q8K389 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdk5rap2Q8K389 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdk5rap2Q8K389 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdk5rap2Q8K389 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdk5rap2Q8K389 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdk5rap2Q8K389 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdk5rap2Q8K389 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms