Protein–RNA interactions for Protein: Q8K305

Nsl1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsl1Q8K305 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nsl1Q8K305 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nsl1Q8K305 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nsl1Q8K305 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nsl1Q8K305 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nsl1Q8K305 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nsl1Q8K305 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nsl1Q8K305 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nsl1Q8K305 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nsl1Q8K305 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nsl1Q8K305 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nsl1Q8K305 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nsl1Q8K305 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nsl1Q8K305 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nsl1Q8K305 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nsl1Q8K305 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nsl1Q8K305 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nsl1Q8K305 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nsl1Q8K305 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nsl1Q8K305 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nsl1Q8K305 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nsl1Q8K305 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nsl1Q8K305 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nsl1Q8K305 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nsl1Q8K305 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nsl1Q8K305 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nsl1Q8K305 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nsl1Q8K305 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nsl1Q8K305 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nsl1Q8K305 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nsl1Q8K305 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nsl1Q8K305 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nsl1Q8K305 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nsl1Q8K305 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nsl1Q8K305 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nsl1Q8K305 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nsl1Q8K305 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nsl1Q8K305 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nsl1Q8K305 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nsl1Q8K305 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nsl1Q8K305 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nsl1Q8K305 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nsl1Q8K305 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nsl1Q8K305 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nsl1Q8K305 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nsl1Q8K305 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nsl1Q8K305 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nsl1Q8K305 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nsl1Q8K305 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nsl1Q8K305 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nsl1Q8K305 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nsl1Q8K305 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nsl1Q8K305 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nsl1Q8K305 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nsl1Q8K305 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nsl1Q8K305 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nsl1Q8K305 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nsl1Q8K305 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nsl1Q8K305 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nsl1Q8K305 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nsl1Q8K305 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nsl1Q8K305 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nsl1Q8K305 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nsl1Q8K305 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nsl1Q8K305 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nsl1Q8K305 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nsl1Q8K305 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nsl1Q8K305 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nsl1Q8K305 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nsl1Q8K305 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nsl1Q8K305 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nsl1Q8K305 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nsl1Q8K305 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nsl1Q8K305 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nsl1Q8K305 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms