Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ncapd2Q8K2Z4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ncapd2Q8K2Z4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Ncapd2Q8K2Z4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ncapd2Q8K2Z4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ncapd2Q8K2Z4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ncapd2Q8K2Z4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ncapd2Q8K2Z4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ncapd2Q8K2Z4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ncapd2Q8K2Z4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ncapd2Q8K2Z4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ncapd2Q8K2Z4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ncapd2Q8K2Z4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ncapd2Q8K2Z4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ncapd2Q8K2Z4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ncapd2Q8K2Z4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ncapd2Q8K2Z4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ncapd2Q8K2Z4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ncapd2Q8K2Z4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ncapd2Q8K2Z4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ncapd2Q8K2Z4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ncapd2Q8K2Z4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ncapd2Q8K2Z4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ncapd2Q8K2Z4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ncapd2Q8K2Z4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ncapd2Q8K2Z4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ncapd2Q8K2Z4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ncapd2Q8K2Z4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ncapd2Q8K2Z4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ncapd2Q8K2Z4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ncapd2Q8K2Z4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ncapd2Q8K2Z4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ncapd2Q8K2Z4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ncapd2Q8K2Z4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ncapd2Q8K2Z4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ncapd2Q8K2Z4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ncapd2Q8K2Z4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ncapd2Q8K2Z4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ncapd2Q8K2Z4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ncapd2Q8K2Z4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ncapd2Q8K2Z4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ncapd2Q8K2Z4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ncapd2Q8K2Z4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ncapd2Q8K2Z4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ncapd2Q8K2Z4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ncapd2Q8K2Z4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ncapd2Q8K2Z4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ncapd2Q8K2Z4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ncapd2Q8K2Z4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ncapd2Q8K2Z4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ncapd2Q8K2Z4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ncapd2Q8K2Z4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ncapd2Q8K2Z4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ncapd2Q8K2Z4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ncapd2Q8K2Z4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ncapd2Q8K2Z4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ncapd2Q8K2Z4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ncapd2Q8K2Z4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ncapd2Q8K2Z4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ncapd2Q8K2Z4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ncapd2Q8K2Z4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ncapd2Q8K2Z4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ncapd2Q8K2Z4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ncapd2Q8K2Z4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ncapd2Q8K2Z4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ncapd2Q8K2Z4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ncapd2Q8K2Z4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ncapd2Q8K2Z4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ncapd2Q8K2Z4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ncapd2Q8K2Z4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ncapd2Q8K2Z4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ncapd2Q8K2Z4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ncapd2Q8K2Z4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ncapd2Q8K2Z4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ncapd2Q8K2Z4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ncapd2Q8K2Z4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ncapd2Q8K2Z4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ncapd2Q8K2Z4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ncapd2Q8K2Z4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ncapd2Q8K2Z4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ncapd2Q8K2Z4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ncapd2Q8K2Z4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ncapd2Q8K2Z4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ncapd2Q8K2Z4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ncapd2Q8K2Z4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ncapd2Q8K2Z4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ncapd2Q8K2Z4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ncapd2Q8K2Z4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ncapd2Q8K2Z4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ncapd2Q8K2Z4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ncapd2Q8K2Z4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ncapd2Q8K2Z4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ncapd2Q8K2Z4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ncapd2Q8K2Z4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ncapd2Q8K2Z4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ncapd2Q8K2Z4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ncapd2Q8K2Z4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ncapd2Q8K2Z4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ncapd2Q8K2Z4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms