Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y9

Ccm2, Cerebral cavernous malformations protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2Q8K2Y9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms