Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X2

Rbm48, RNA-binding protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm48Q8K2X2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Rbm48Q8K2X2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbm48Q8K2X2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbm48Q8K2X2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbm48Q8K2X2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbm48Q8K2X2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Rbm48Q8K2X2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbm48Q8K2X2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbm48Q8K2X2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Rbm48Q8K2X2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm48Q8K2X2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Rbm48Q8K2X2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Rbm48Q8K2X2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm48Q8K2X2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm48Q8K2X2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm48Q8K2X2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm48Q8K2X2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm48Q8K2X2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Rbm48Q8K2X2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm48Q8K2X2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm48Q8K2X2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Rbm48Q8K2X2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Rbm48Q8K2X2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Rbm48Q8K2X2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Rbm48Q8K2X2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Rbm48Q8K2X2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbm48Q8K2X2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbm48Q8K2X2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbm48Q8K2X2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbm48Q8K2X2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbm48Q8K2X2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm48Q8K2X2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm48Q8K2X2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm48Q8K2X2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm48Q8K2X2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm48Q8K2X2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm48Q8K2X2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Rbm48Q8K2X2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Rbm48Q8K2X2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Rbm48Q8K2X2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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