Protein–RNA interactions for Protein: Q8K274

Fn3krp, Ketosamine-3-kinase, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fn3krpQ8K274 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fn3krpQ8K274 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms