Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Abcf3Q8K268 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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