Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms