Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0Y2

Krt33a, Keratin, type I cuticular Ha3-I, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt33aQ8K0Y2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms