Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0U3

Tmem17, Transmembrane protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem17Q8K0U3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem17Q8K0U3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem17Q8K0U3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem17Q8K0U3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem17Q8K0U3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem17Q8K0U3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem17Q8K0U3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem17Q8K0U3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem17Q8K0U3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem17Q8K0U3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem17Q8K0U3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem17Q8K0U3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem17Q8K0U3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem17Q8K0U3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem17Q8K0U3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem17Q8K0U3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem17Q8K0U3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem17Q8K0U3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem17Q8K0U3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem17Q8K0U3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem17Q8K0U3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem17Q8K0U3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem17Q8K0U3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem17Q8K0U3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem17Q8K0U3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem17Q8K0U3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem17Q8K0U3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem17Q8K0U3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem17Q8K0U3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem17Q8K0U3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem17Q8K0U3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem17Q8K0U3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem17Q8K0U3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem17Q8K0U3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem17Q8K0U3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem17Q8K0U3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem17Q8K0U3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem17Q8K0U3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem17Q8K0U3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem17Q8K0U3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem17Q8K0U3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem17Q8K0U3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem17Q8K0U3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem17Q8K0U3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem17Q8K0U3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem17Q8K0U3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem17Q8K0U3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem17Q8K0U3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem17Q8K0U3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.1 ms