Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0B2

Lmbrd1, Probable lysosomal cobalamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd1Q8K0B2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lmbrd1Q8K0B2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lmbrd1Q8K0B2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lmbrd1Q8K0B2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lmbrd1Q8K0B2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lmbrd1Q8K0B2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lmbrd1Q8K0B2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lmbrd1Q8K0B2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lmbrd1Q8K0B2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Lmbrd1Q8K0B2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lmbrd1Q8K0B2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lmbrd1Q8K0B2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lmbrd1Q8K0B2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lmbrd1Q8K0B2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lmbrd1Q8K0B2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lmbrd1Q8K0B2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lmbrd1Q8K0B2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lmbrd1Q8K0B2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lmbrd1Q8K0B2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lmbrd1Q8K0B2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lmbrd1Q8K0B2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lmbrd1Q8K0B2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lmbrd1Q8K0B2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lmbrd1Q8K0B2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lmbrd1Q8K0B2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Lmbrd1Q8K0B2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lmbrd1Q8K0B2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lmbrd1Q8K0B2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Lmbrd1Q8K0B2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lmbrd1Q8K0B2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lmbrd1Q8K0B2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lmbrd1Q8K0B2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lmbrd1Q8K0B2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lmbrd1Q8K0B2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lmbrd1Q8K0B2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lmbrd1Q8K0B2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Lmbrd1Q8K0B2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lmbrd1Q8K0B2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lmbrd1Q8K0B2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lmbrd1Q8K0B2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lmbrd1Q8K0B2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lmbrd1Q8K0B2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmbrd1Q8K0B2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmbrd1Q8K0B2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmbrd1Q8K0B2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmbrd1Q8K0B2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmbrd1Q8K0B2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmbrd1Q8K0B2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmbrd1Q8K0B2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmbrd1Q8K0B2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmbrd1Q8K0B2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmbrd1Q8K0B2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmbrd1Q8K0B2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmbrd1Q8K0B2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmbrd1Q8K0B2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmbrd1Q8K0B2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmbrd1Q8K0B2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmbrd1Q8K0B2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmbrd1Q8K0B2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmbrd1Q8K0B2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmbrd1Q8K0B2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmbrd1Q8K0B2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmbrd1Q8K0B2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmbrd1Q8K0B2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lmbrd1Q8K0B2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lmbrd1Q8K0B2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lmbrd1Q8K0B2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lmbrd1Q8K0B2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lmbrd1Q8K0B2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lmbrd1Q8K0B2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lmbrd1Q8K0B2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Lmbrd1Q8K0B2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lmbrd1Q8K0B2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms