Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rab11fip3Q8CHD8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rab11fip3Q8CHD8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rab11fip3Q8CHD8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab11fip3Q8CHD8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab11fip3Q8CHD8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab11fip3Q8CHD8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab11fip3Q8CHD8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab11fip3Q8CHD8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab11fip3Q8CHD8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab11fip3Q8CHD8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab11fip3Q8CHD8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rab11fip3Q8CHD8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rab11fip3Q8CHD8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rab11fip3Q8CHD8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rab11fip3Q8CHD8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rab11fip3Q8CHD8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rab11fip3Q8CHD8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rab11fip3Q8CHD8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rab11fip3Q8CHD8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rab11fip3Q8CHD8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rab11fip3Q8CHD8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rab11fip3Q8CHD8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rab11fip3Q8CHD8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rab11fip3Q8CHD8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rab11fip3Q8CHD8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rab11fip3Q8CHD8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rab11fip3Q8CHD8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rab11fip3Q8CHD8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rab11fip3Q8CHD8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rab11fip3Q8CHD8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rab11fip3Q8CHD8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rab11fip3Q8CHD8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rab11fip3Q8CHD8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rab11fip3Q8CHD8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rab11fip3Q8CHD8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rab11fip3Q8CHD8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rab11fip3Q8CHD8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rab11fip3Q8CHD8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rab11fip3Q8CHD8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rab11fip3Q8CHD8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rab11fip3Q8CHD8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rab11fip3Q8CHD8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rab11fip3Q8CHD8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rab11fip3Q8CHD8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rab11fip3Q8CHD8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rab11fip3Q8CHD8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Rab11fip3Q8CHD8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rab11fip3Q8CHD8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rab11fip3Q8CHD8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rab11fip3Q8CHD8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rab11fip3Q8CHD8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rab11fip3Q8CHD8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rab11fip3Q8CHD8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rab11fip3Q8CHD8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rab11fip3Q8CHD8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rab11fip3Q8CHD8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rab11fip3Q8CHD8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rab11fip3Q8CHD8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rab11fip3Q8CHD8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rab11fip3Q8CHD8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rab11fip3Q8CHD8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rab11fip3Q8CHD8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rab11fip3Q8CHD8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rab11fip3Q8CHD8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rab11fip3Q8CHD8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rab11fip3Q8CHD8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rab11fip3Q8CHD8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab11fip3Q8CHD8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab11fip3Q8CHD8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab11fip3Q8CHD8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab11fip3Q8CHD8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab11fip3Q8CHD8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab11fip3Q8CHD8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab11fip3Q8CHD8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab11fip3Q8CHD8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab11fip3Q8CHD8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab11fip3Q8CHD8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab11fip3Q8CHD8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rab11fip3Q8CHD8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rab11fip3Q8CHD8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rab11fip3Q8CHD8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rab11fip3Q8CHD8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Rab11fip3Q8CHD8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rab11fip3Q8CHD8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rab11fip3Q8CHD8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rab11fip3Q8CHD8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rab11fip3Q8CHD8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Rab11fip3Q8CHD8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rab11fip3Q8CHD8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rab11fip3Q8CHD8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rab11fip3Q8CHD8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
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