Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGF7

Tcerg1, Transcription elongation regulator 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,100 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcerg1Q8CGF7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tcerg1Q8CGF7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tcerg1Q8CGF7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tcerg1Q8CGF7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tcerg1Q8CGF7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tcerg1Q8CGF7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Tcerg1Q8CGF7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Tcerg1Q8CGF7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tcerg1Q8CGF7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tcerg1Q8CGF7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tcerg1Q8CGF7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tcerg1Q8CGF7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tcerg1Q8CGF7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tcerg1Q8CGF7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tcerg1Q8CGF7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Tcerg1Q8CGF7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tcerg1Q8CGF7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Tcerg1Q8CGF7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tcerg1Q8CGF7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tcerg1Q8CGF7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tcerg1Q8CGF7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tcerg1Q8CGF7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tcerg1Q8CGF7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tcerg1Q8CGF7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tcerg1Q8CGF7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tcerg1Q8CGF7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tcerg1Q8CGF7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tcerg1Q8CGF7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tcerg1Q8CGF7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tcerg1Q8CGF7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tcerg1Q8CGF7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tcerg1Q8CGF7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tcerg1Q8CGF7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tcerg1Q8CGF7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tcerg1Q8CGF7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tcerg1Q8CGF7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tcerg1Q8CGF7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tcerg1Q8CGF7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tcerg1Q8CGF7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tcerg1Q8CGF7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tcerg1Q8CGF7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tcerg1Q8CGF7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tcerg1Q8CGF7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tcerg1Q8CGF7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tcerg1Q8CGF7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tcerg1Q8CGF7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tcerg1Q8CGF7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tcerg1Q8CGF7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tcerg1Q8CGF7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tcerg1Q8CGF7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tcerg1Q8CGF7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tcerg1Q8CGF7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tcerg1Q8CGF7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tcerg1Q8CGF7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tcerg1Q8CGF7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tcerg1Q8CGF7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tcerg1Q8CGF7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tcerg1Q8CGF7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tcerg1Q8CGF7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Tcerg1Q8CGF7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tcerg1Q8CGF7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tcerg1Q8CGF7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Tcerg1Q8CGF7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tcerg1Q8CGF7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tcerg1Q8CGF7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tcerg1Q8CGF7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tcerg1Q8CGF7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tcerg1Q8CGF7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tcerg1Q8CGF7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
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