Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup88Q8CEC0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup88Q8CEC0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup88Q8CEC0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup88Q8CEC0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup88Q8CEC0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup88Q8CEC0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup88Q8CEC0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nup88Q8CEC0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nup88Q8CEC0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nup88Q8CEC0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nup88Q8CEC0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nup88Q8CEC0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nup88Q8CEC0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nup88Q8CEC0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nup88Q8CEC0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nup88Q8CEC0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nup88Q8CEC0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nup88Q8CEC0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nup88Q8CEC0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nup88Q8CEC0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nup88Q8CEC0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nup88Q8CEC0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nup88Q8CEC0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nup88Q8CEC0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nup88Q8CEC0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nup88Q8CEC0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nup88Q8CEC0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Nup88Q8CEC0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nup88Q8CEC0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nup88Q8CEC0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nup88Q8CEC0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nup88Q8CEC0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nup88Q8CEC0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nup88Q8CEC0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nup88Q8CEC0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Nup88Q8CEC0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nup88Q8CEC0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nup88Q8CEC0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nup88Q8CEC0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nup88Q8CEC0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Nup88Q8CEC0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nup88Q8CEC0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nup88Q8CEC0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nup88Q8CEC0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Nup88Q8CEC0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Nup88Q8CEC0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nup88Q8CEC0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nup88Q8CEC0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nup88Q8CEC0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nup88Q8CEC0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Nup88Q8CEC0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nup88Q8CEC0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nup88Q8CEC0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nup88Q8CEC0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nup88Q8CEC0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nup88Q8CEC0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Nup88Q8CEC0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nup88Q8CEC0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nup88Q8CEC0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nup88Q8CEC0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nup88Q8CEC0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nup88Q8CEC0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nup88Q8CEC0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nup88Q8CEC0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nup88Q8CEC0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nup88Q8CEC0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nup88Q8CEC0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nup88Q8CEC0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nup88Q8CEC0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nup88Q8CEC0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nup88Q8CEC0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nup88Q8CEC0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nup88Q8CEC0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nup88Q8CEC0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nup88Q8CEC0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nup88Q8CEC0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nup88Q8CEC0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nup88Q8CEC0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nup88Q8CEC0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nup88Q8CEC0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nup88Q8CEC0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nup88Q8CEC0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nup88Q8CEC0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nup88Q8CEC0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nup88Q8CEC0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nup88Q8CEC0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nup88Q8CEC0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nup88Q8CEC0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nup88Q8CEC0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nup88Q8CEC0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nup88Q8CEC0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nup88Q8CEC0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nup88Q8CEC0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nup88Q8CEC0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nup88Q8CEC0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nup88Q8CEC0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nup88Q8CEC0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Nup88Q8CEC0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nup88Q8CEC0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms