Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms