Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nrip1Q8CBD1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nrip1Q8CBD1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nrip1Q8CBD1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nrip1Q8CBD1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nrip1Q8CBD1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nrip1Q8CBD1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nrip1Q8CBD1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nrip1Q8CBD1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nrip1Q8CBD1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nrip1Q8CBD1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nrip1Q8CBD1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nrip1Q8CBD1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nrip1Q8CBD1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nrip1Q8CBD1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.8 ms