Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slfn5Q8CBA2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Slfn5Q8CBA2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slfn5Q8CBA2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slfn5Q8CBA2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slfn5Q8CBA2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slfn5Q8CBA2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slfn5Q8CBA2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slfn5Q8CBA2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slfn5Q8CBA2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slfn5Q8CBA2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slfn5Q8CBA2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slfn5Q8CBA2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slfn5Q8CBA2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slfn5Q8CBA2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slfn5Q8CBA2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Slfn5Q8CBA2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slfn5Q8CBA2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slfn5Q8CBA2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slfn5Q8CBA2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slfn5Q8CBA2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slfn5Q8CBA2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slfn5Q8CBA2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slfn5Q8CBA2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slfn5Q8CBA2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slfn5Q8CBA2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slfn5Q8CBA2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slfn5Q8CBA2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slfn5Q8CBA2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slfn5Q8CBA2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slfn5Q8CBA2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slfn5Q8CBA2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slfn5Q8CBA2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slfn5Q8CBA2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slfn5Q8CBA2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slfn5Q8CBA2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slfn5Q8CBA2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slfn5Q8CBA2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slfn5Q8CBA2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Slfn5Q8CBA2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slfn5Q8CBA2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slfn5Q8CBA2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slfn5Q8CBA2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slfn5Q8CBA2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slfn5Q8CBA2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slfn5Q8CBA2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slfn5Q8CBA2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slfn5Q8CBA2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slfn5Q8CBA2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slfn5Q8CBA2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slfn5Q8CBA2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slfn5Q8CBA2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slfn5Q8CBA2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slfn5Q8CBA2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slfn5Q8CBA2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slfn5Q8CBA2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slfn5Q8CBA2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Slfn5Q8CBA2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Slfn5Q8CBA2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Slfn5Q8CBA2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slfn5Q8CBA2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slfn5Q8CBA2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slfn5Q8CBA2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slfn5Q8CBA2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slfn5Q8CBA2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slfn5Q8CBA2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slfn5Q8CBA2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slfn5Q8CBA2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slfn5Q8CBA2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slfn5Q8CBA2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slfn5Q8CBA2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slfn5Q8CBA2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slfn5Q8CBA2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slfn5Q8CBA2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Slfn5Q8CBA2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Slfn5Q8CBA2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slfn5Q8CBA2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slfn5Q8CBA2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slfn5Q8CBA2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slfn5Q8CBA2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Slfn5Q8CBA2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Slfn5Q8CBA2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Slfn5Q8CBA2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Slfn5Q8CBA2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Slfn5Q8CBA2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Slfn5Q8CBA2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Slfn5Q8CBA2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Slfn5Q8CBA2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Slfn5Q8CBA2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Slfn5Q8CBA2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Slfn5Q8CBA2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Slfn5Q8CBA2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Slfn5Q8CBA2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Slfn5Q8CBA2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Slfn5Q8CBA2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Slfn5Q8CBA2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Slfn5Q8CBA2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Slfn5Q8CBA2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Slfn5Q8CBA2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Slfn5Q8CBA2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms