Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8N3

Vwc2, Brorin, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwc2Q8C8N3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vwc2Q8C8N3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vwc2Q8C8N3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vwc2Q8C8N3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vwc2Q8C8N3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vwc2Q8C8N3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vwc2Q8C8N3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Vwc2Q8C8N3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vwc2Q8C8N3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vwc2Q8C8N3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vwc2Q8C8N3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vwc2Q8C8N3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vwc2Q8C8N3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vwc2Q8C8N3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vwc2Q8C8N3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vwc2Q8C8N3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vwc2Q8C8N3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vwc2Q8C8N3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vwc2Q8C8N3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vwc2Q8C8N3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vwc2Q8C8N3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vwc2Q8C8N3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vwc2Q8C8N3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vwc2Q8C8N3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vwc2Q8C8N3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms