Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5Z9

4930504O13Rik, RIKEN cDNA 4930504O13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
4930504O13RikQ8C5Z9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
4930504O13RikQ8C5Z9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930504O13RikQ8C5Z9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930504O13RikQ8C5Z9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
4930504O13RikQ8C5Z9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930504O13RikQ8C5Z9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930504O13RikQ8C5Z9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930504O13RikQ8C5Z9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930504O13RikQ8C5Z9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
4930504O13RikQ8C5Z9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930504O13RikQ8C5Z9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930504O13RikQ8C5Z9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930504O13RikQ8C5Z9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930504O13RikQ8C5Z9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930504O13RikQ8C5Z9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930504O13RikQ8C5Z9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930504O13RikQ8C5Z9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms