Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cwc22Q8C5N3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Cwc22Q8C5N3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Cwc22Q8C5N3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Cwc22Q8C5N3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cwc22Q8C5N3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cwc22Q8C5N3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cwc22Q8C5N3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cwc22Q8C5N3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cwc22Q8C5N3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cwc22Q8C5N3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Cwc22Q8C5N3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cwc22Q8C5N3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cwc22Q8C5N3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cwc22Q8C5N3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cwc22Q8C5N3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cwc22Q8C5N3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cwc22Q8C5N3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cwc22Q8C5N3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cwc22Q8C5N3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cwc22Q8C5N3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cwc22Q8C5N3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cwc22Q8C5N3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cwc22Q8C5N3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cwc22Q8C5N3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cwc22Q8C5N3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Cwc22Q8C5N3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cwc22Q8C5N3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Cwc22Q8C5N3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cwc22Q8C5N3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cwc22Q8C5N3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cwc22Q8C5N3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cwc22Q8C5N3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cwc22Q8C5N3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cwc22Q8C5N3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cwc22Q8C5N3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cwc22Q8C5N3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cwc22Q8C5N3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cwc22Q8C5N3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cwc22Q8C5N3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cwc22Q8C5N3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cwc22Q8C5N3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cwc22Q8C5N3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cwc22Q8C5N3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cwc22Q8C5N3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cwc22Q8C5N3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cwc22Q8C5N3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cwc22Q8C5N3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cwc22Q8C5N3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Cwc22Q8C5N3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cwc22Q8C5N3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cwc22Q8C5N3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cwc22Q8C5N3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cwc22Q8C5N3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cwc22Q8C5N3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cwc22Q8C5N3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cwc22Q8C5N3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cwc22Q8C5N3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cwc22Q8C5N3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cwc22Q8C5N3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cwc22Q8C5N3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cwc22Q8C5N3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cwc22Q8C5N3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cwc22Q8C5N3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cwc22Q8C5N3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cwc22Q8C5N3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cwc22Q8C5N3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Cwc22Q8C5N3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cwc22Q8C5N3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Cwc22Q8C5N3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cwc22Q8C5N3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cwc22Q8C5N3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cwc22Q8C5N3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cwc22Q8C5N3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cwc22Q8C5N3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cwc22Q8C5N3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cwc22Q8C5N3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cwc22Q8C5N3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cwc22Q8C5N3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cwc22Q8C5N3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cwc22Q8C5N3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cwc22Q8C5N3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cwc22Q8C5N3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cwc22Q8C5N3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cwc22Q8C5N3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cwc22Q8C5N3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cwc22Q8C5N3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cwc22Q8C5N3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cwc22Q8C5N3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cwc22Q8C5N3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cwc22Q8C5N3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cwc22Q8C5N3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cwc22Q8C5N3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cwc22Q8C5N3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cwc22Q8C5N3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cwc22Q8C5N3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cwc22Q8C5N3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cwc22Q8C5N3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cwc22Q8C5N3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cwc22Q8C5N3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms