Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot2Q8C5L3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot2Q8C5L3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot2Q8C5L3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot2Q8C5L3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot2Q8C5L3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot2Q8C5L3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot2Q8C5L3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot2Q8C5L3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot2Q8C5L3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot2Q8C5L3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot2Q8C5L3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot2Q8C5L3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot2Q8C5L3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot2Q8C5L3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot2Q8C5L3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot2Q8C5L3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot2Q8C5L3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot2Q8C5L3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot2Q8C5L3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot2Q8C5L3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot2Q8C5L3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot2Q8C5L3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot2Q8C5L3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot2Q8C5L3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot2Q8C5L3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot2Q8C5L3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot2Q8C5L3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot2Q8C5L3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot2Q8C5L3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot2Q8C5L3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot2Q8C5L3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot2Q8C5L3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot2Q8C5L3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot2Q8C5L3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot2Q8C5L3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot2Q8C5L3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cnot2Q8C5L3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cnot2Q8C5L3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cnot2Q8C5L3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms