Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXF8

Actrt3, Actin-related protein T3, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt3Q8BXF8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Actrt3Q8BXF8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Actrt3Q8BXF8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Actrt3Q8BXF8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Actrt3Q8BXF8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Actrt3Q8BXF8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Actrt3Q8BXF8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Actrt3Q8BXF8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Actrt3Q8BXF8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Actrt3Q8BXF8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Actrt3Q8BXF8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Actrt3Q8BXF8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Actrt3Q8BXF8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Actrt3Q8BXF8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Actrt3Q8BXF8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Actrt3Q8BXF8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Actrt3Q8BXF8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Actrt3Q8BXF8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Actrt3Q8BXF8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Actrt3Q8BXF8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Actrt3Q8BXF8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Actrt3Q8BXF8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Actrt3Q8BXF8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Actrt3Q8BXF8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Actrt3Q8BXF8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Actrt3Q8BXF8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Actrt3Q8BXF8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Actrt3Q8BXF8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Actrt3Q8BXF8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Actrt3Q8BXF8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Actrt3Q8BXF8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Actrt3Q8BXF8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Actrt3Q8BXF8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Actrt3Q8BXF8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Actrt3Q8BXF8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Actrt3Q8BXF8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Actrt3Q8BXF8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Actrt3Q8BXF8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Actrt3Q8BXF8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Actrt3Q8BXF8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Actrt3Q8BXF8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Actrt3Q8BXF8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Actrt3Q8BXF8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Actrt3Q8BXF8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Actrt3Q8BXF8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Actrt3Q8BXF8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Actrt3Q8BXF8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Actrt3Q8BXF8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Actrt3Q8BXF8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Actrt3Q8BXF8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Actrt3Q8BXF8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Actrt3Q8BXF8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Actrt3Q8BXF8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Actrt3Q8BXF8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Actrt3Q8BXF8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Actrt3Q8BXF8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Actrt3Q8BXF8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Actrt3Q8BXF8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Actrt3Q8BXF8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Actrt3Q8BXF8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Actrt3Q8BXF8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Actrt3Q8BXF8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Actrt3Q8BXF8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Actrt3Q8BXF8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Actrt3Q8BXF8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Actrt3Q8BXF8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Actrt3Q8BXF8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Actrt3Q8BXF8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Actrt3Q8BXF8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Actrt3Q8BXF8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Actrt3Q8BXF8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Actrt3Q8BXF8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Actrt3Q8BXF8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Actrt3Q8BXF8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Actrt3Q8BXF8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Actrt3Q8BXF8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Actrt3Q8BXF8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Actrt3Q8BXF8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Actrt3Q8BXF8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Actrt3Q8BXF8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Actrt3Q8BXF8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Actrt3Q8BXF8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Actrt3Q8BXF8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Actrt3Q8BXF8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Actrt3Q8BXF8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Actrt3Q8BXF8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Actrt3Q8BXF8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Actrt3Q8BXF8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Actrt3Q8BXF8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Actrt3Q8BXF8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Actrt3Q8BXF8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Actrt3Q8BXF8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Actrt3Q8BXF8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Actrt3Q8BXF8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Actrt3Q8BXF8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Actrt3Q8BXF8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Actrt3Q8BXF8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Actrt3Q8BXF8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Actrt3Q8BXF8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Actrt3Q8BXF8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms