Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX32

Slx1b, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx1bQ8BX32 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slx1bQ8BX32 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slx1bQ8BX32 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slx1bQ8BX32 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Slx1bQ8BX32 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slx1bQ8BX32 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Slx1bQ8BX32 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slx1bQ8BX32 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slx1bQ8BX32 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slx1bQ8BX32 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slx1bQ8BX32 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slx1bQ8BX32 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slx1bQ8BX32 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slx1bQ8BX32 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slx1bQ8BX32 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slx1bQ8BX32 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slx1bQ8BX32 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slx1bQ8BX32 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slx1bQ8BX32 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Slx1bQ8BX32 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slx1bQ8BX32 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slx1bQ8BX32 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slx1bQ8BX32 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slx1bQ8BX32 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Slx1bQ8BX32 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slx1bQ8BX32 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slx1bQ8BX32 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slx1bQ8BX32 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Slx1bQ8BX32 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slx1bQ8BX32 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slx1bQ8BX32 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slx1bQ8BX32 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slx1bQ8BX32 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slx1bQ8BX32 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slx1bQ8BX32 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slx1bQ8BX32 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slx1bQ8BX32 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slx1bQ8BX32 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slx1bQ8BX32 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slx1bQ8BX32 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slx1bQ8BX32 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slx1bQ8BX32 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Slx1bQ8BX32 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slx1bQ8BX32 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slx1bQ8BX32 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slx1bQ8BX32 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slx1bQ8BX32 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slx1bQ8BX32 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slx1bQ8BX32 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slx1bQ8BX32 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slx1bQ8BX32 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slx1bQ8BX32 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Slx1bQ8BX32 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slx1bQ8BX32 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slx1bQ8BX32 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Slx1bQ8BX32 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Slx1bQ8BX32 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Slx1bQ8BX32 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slx1bQ8BX32 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slx1bQ8BX32 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slx1bQ8BX32 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slx1bQ8BX32 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slx1bQ8BX32 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Slx1bQ8BX32 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slx1bQ8BX32 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slx1bQ8BX32 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slx1bQ8BX32 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slx1bQ8BX32 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Slx1bQ8BX32 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slx1bQ8BX32 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slx1bQ8BX32 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slx1bQ8BX32 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slx1bQ8BX32 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slx1bQ8BX32 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slx1bQ8BX32 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slx1bQ8BX32 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slx1bQ8BX32 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slx1bQ8BX32 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slx1bQ8BX32 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slx1bQ8BX32 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slx1bQ8BX32 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slx1bQ8BX32 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slx1bQ8BX32 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slx1bQ8BX32 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slx1bQ8BX32 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slx1bQ8BX32 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slx1bQ8BX32 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slx1bQ8BX32 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slx1bQ8BX32 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slx1bQ8BX32 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slx1bQ8BX32 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slx1bQ8BX32 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slx1bQ8BX32 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slx1bQ8BX32 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slx1bQ8BX32 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slx1bQ8BX32 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slx1bQ8BX32 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slx1bQ8BX32 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slx1bQ8BX32 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slx1bQ8BX32 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms