Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms