Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
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