Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp38Q8BW70 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp38Q8BW70 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp38Q8BW70 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp38Q8BW70 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp38Q8BW70 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp38Q8BW70 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp38Q8BW70 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp38Q8BW70 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp38Q8BW70 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp38Q8BW70 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp38Q8BW70 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp38Q8BW70 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp38Q8BW70 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp38Q8BW70 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp38Q8BW70 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp38Q8BW70 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp38Q8BW70 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp38Q8BW70 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
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Usp38Q8BW70 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp38Q8BW70 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp38Q8BW70 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp38Q8BW70 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp38Q8BW70 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp38Q8BW70 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp38Q8BW70 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp38Q8BW70 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp38Q8BW70 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp38Q8BW70 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp38Q8BW70 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp38Q8BW70 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp38Q8BW70 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp38Q8BW70 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp38Q8BW70 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp38Q8BW70 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp38Q8BW70 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp38Q8BW70 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
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Usp38Q8BW70 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp38Q8BW70 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
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Usp38Q8BW70 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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Usp38Q8BW70 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Usp38Q8BW70 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp38Q8BW70 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp38Q8BW70 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp38Q8BW70 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp38Q8BW70 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp38Q8BW70 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp38Q8BW70 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp38Q8BW70 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp38Q8BW70 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp38Q8BW70 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp38Q8BW70 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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Usp38Q8BW70 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp38Q8BW70 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp38Q8BW70 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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Usp38Q8BW70 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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Usp38Q8BW70 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp38Q8BW70 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp38Q8BW70 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp38Q8BW70 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp38Q8BW70 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp38Q8BW70 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp38Q8BW70 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp38Q8BW70 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp38Q8BW70 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp38Q8BW70 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp38Q8BW70 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp38Q8BW70 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp38Q8BW70 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp38Q8BW70 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp38Q8BW70 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp38Q8BW70 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp38Q8BW70 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp38Q8BW70 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp38Q8BW70 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp38Q8BW70 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp38Q8BW70 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp38Q8BW70 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp38Q8BW70 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp38Q8BW70 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp38Q8BW70 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp38Q8BW70 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp38Q8BW70 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp38Q8BW70 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
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