Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII3

D130040H23Rik, RIKEN cDNA D130040H23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130040H23RikQ8BII3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
D130040H23RikQ8BII3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
D130040H23RikQ8BII3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
D130040H23RikQ8BII3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
D130040H23RikQ8BII3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
D130040H23RikQ8BII3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
D130040H23RikQ8BII3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
D130040H23RikQ8BII3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
D130040H23RikQ8BII3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
D130040H23RikQ8BII3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
D130040H23RikQ8BII3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
D130040H23RikQ8BII3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
D130040H23RikQ8BII3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
D130040H23RikQ8BII3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
D130040H23RikQ8BII3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
D130040H23RikQ8BII3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
D130040H23RikQ8BII3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
D130040H23RikQ8BII3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
D130040H23RikQ8BII3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
D130040H23RikQ8BII3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
D130040H23RikQ8BII3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
D130040H23RikQ8BII3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
D130040H23RikQ8BII3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
D130040H23RikQ8BII3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
D130040H23RikQ8BII3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
D130040H23RikQ8BII3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
D130040H23RikQ8BII3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
D130040H23RikQ8BII3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
D130040H23RikQ8BII3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
D130040H23RikQ8BII3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
D130040H23RikQ8BII3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
D130040H23RikQ8BII3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
D130040H23RikQ8BII3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
D130040H23RikQ8BII3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
D130040H23RikQ8BII3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
D130040H23RikQ8BII3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
D130040H23RikQ8BII3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
D130040H23RikQ8BII3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
D130040H23RikQ8BII3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
D130040H23RikQ8BII3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
D130040H23RikQ8BII3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
D130040H23RikQ8BII3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
D130040H23RikQ8BII3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
D130040H23RikQ8BII3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
D130040H23RikQ8BII3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
D130040H23RikQ8BII3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
D130040H23RikQ8BII3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
D130040H23RikQ8BII3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
D130040H23RikQ8BII3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
D130040H23RikQ8BII3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
D130040H23RikQ8BII3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
D130040H23RikQ8BII3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
D130040H23RikQ8BII3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
D130040H23RikQ8BII3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
D130040H23RikQ8BII3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
D130040H23RikQ8BII3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
D130040H23RikQ8BII3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
D130040H23RikQ8BII3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
D130040H23RikQ8BII3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
D130040H23RikQ8BII3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
D130040H23RikQ8BII3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
D130040H23RikQ8BII3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
D130040H23RikQ8BII3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
D130040H23RikQ8BII3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
D130040H23RikQ8BII3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
D130040H23RikQ8BII3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
D130040H23RikQ8BII3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
D130040H23RikQ8BII3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
D130040H23RikQ8BII3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
D130040H23RikQ8BII3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
D130040H23RikQ8BII3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
D130040H23RikQ8BII3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
D130040H23RikQ8BII3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
D130040H23RikQ8BII3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
D130040H23RikQ8BII3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
D130040H23RikQ8BII3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
D130040H23RikQ8BII3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
D130040H23RikQ8BII3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
D130040H23RikQ8BII3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
D130040H23RikQ8BII3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
D130040H23RikQ8BII3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
D130040H23RikQ8BII3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
D130040H23RikQ8BII3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
D130040H23RikQ8BII3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
D130040H23RikQ8BII3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
D130040H23RikQ8BII3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
D130040H23RikQ8BII3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
D130040H23RikQ8BII3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
D130040H23RikQ8BII3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
D130040H23RikQ8BII3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
D130040H23RikQ8BII3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
D130040H23RikQ8BII3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
D130040H23RikQ8BII3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
D130040H23RikQ8BII3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
D130040H23RikQ8BII3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
D130040H23RikQ8BII3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
D130040H23RikQ8BII3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
D130040H23RikQ8BII3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
D130040H23RikQ8BII3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
D130040H23RikQ8BII3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms