Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGT7

Smndc1, Survival of motor neuron-related-splicing factor 30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smndc1Q8BGT7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smndc1Q8BGT7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smndc1Q8BGT7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smndc1Q8BGT7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smndc1Q8BGT7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smndc1Q8BGT7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smndc1Q8BGT7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smndc1Q8BGT7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smndc1Q8BGT7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smndc1Q8BGT7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smndc1Q8BGT7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smndc1Q8BGT7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smndc1Q8BGT7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smndc1Q8BGT7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smndc1Q8BGT7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smndc1Q8BGT7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smndc1Q8BGT7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smndc1Q8BGT7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smndc1Q8BGT7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smndc1Q8BGT7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smndc1Q8BGT7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smndc1Q8BGT7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smndc1Q8BGT7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smndc1Q8BGT7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smndc1Q8BGT7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smndc1Q8BGT7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smndc1Q8BGT7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smndc1Q8BGT7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Smndc1Q8BGT7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smndc1Q8BGT7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smndc1Q8BGT7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smndc1Q8BGT7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smndc1Q8BGT7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smndc1Q8BGT7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smndc1Q8BGT7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smndc1Q8BGT7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smndc1Q8BGT7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smndc1Q8BGT7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smndc1Q8BGT7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smndc1Q8BGT7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smndc1Q8BGT7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smndc1Q8BGT7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smndc1Q8BGT7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smndc1Q8BGT7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smndc1Q8BGT7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smndc1Q8BGT7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smndc1Q8BGT7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smndc1Q8BGT7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smndc1Q8BGT7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smndc1Q8BGT7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smndc1Q8BGT7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smndc1Q8BGT7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smndc1Q8BGT7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smndc1Q8BGT7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Smndc1Q8BGT7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smndc1Q8BGT7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smndc1Q8BGT7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smndc1Q8BGT7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Smndc1Q8BGT7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smndc1Q8BGT7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smndc1Q8BGT7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Smndc1Q8BGT7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smndc1Q8BGT7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smndc1Q8BGT7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smndc1Q8BGT7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smndc1Q8BGT7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smndc1Q8BGT7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smndc1Q8BGT7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smndc1Q8BGT7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smndc1Q8BGT7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Smndc1Q8BGT7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smndc1Q8BGT7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smndc1Q8BGT7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smndc1Q8BGT7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smndc1Q8BGT7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smndc1Q8BGT7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smndc1Q8BGT7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smndc1Q8BGT7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smndc1Q8BGT7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smndc1Q8BGT7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smndc1Q8BGT7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smndc1Q8BGT7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smndc1Q8BGT7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smndc1Q8BGT7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smndc1Q8BGT7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smndc1Q8BGT7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smndc1Q8BGT7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smndc1Q8BGT7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smndc1Q8BGT7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smndc1Q8BGT7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smndc1Q8BGT7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smndc1Q8BGT7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smndc1Q8BGT7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smndc1Q8BGT7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smndc1Q8BGT7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smndc1Q8BGT7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smndc1Q8BGT7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smndc1Q8BGT7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smndc1Q8BGT7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smndc1Q8BGT7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms