Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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