Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG71

Trmt12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt12Q8BG71 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms