Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG67

Efr3a, Protein EFR3 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efr3aQ8BG67 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efr3aQ8BG67 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efr3aQ8BG67 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efr3aQ8BG67 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efr3aQ8BG67 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efr3aQ8BG67 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efr3aQ8BG67 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efr3aQ8BG67 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efr3aQ8BG67 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Efr3aQ8BG67 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efr3aQ8BG67 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efr3aQ8BG67 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efr3aQ8BG67 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efr3aQ8BG67 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efr3aQ8BG67 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efr3aQ8BG67 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Efr3aQ8BG67 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efr3aQ8BG67 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efr3aQ8BG67 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efr3aQ8BG67 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efr3aQ8BG67 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efr3aQ8BG67 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efr3aQ8BG67 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efr3aQ8BG67 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efr3aQ8BG67 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efr3aQ8BG67 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efr3aQ8BG67 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efr3aQ8BG67 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efr3aQ8BG67 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efr3aQ8BG67 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efr3aQ8BG67 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efr3aQ8BG67 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efr3aQ8BG67 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Efr3aQ8BG67 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efr3aQ8BG67 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efr3aQ8BG67 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efr3aQ8BG67 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efr3aQ8BG67 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efr3aQ8BG67 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efr3aQ8BG67 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efr3aQ8BG67 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efr3aQ8BG67 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efr3aQ8BG67 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efr3aQ8BG67 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efr3aQ8BG67 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efr3aQ8BG67 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efr3aQ8BG67 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efr3aQ8BG67 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efr3aQ8BG67 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efr3aQ8BG67 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efr3aQ8BG67 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efr3aQ8BG67 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efr3aQ8BG67 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Efr3aQ8BG67 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efr3aQ8BG67 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efr3aQ8BG67 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efr3aQ8BG67 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Efr3aQ8BG67 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efr3aQ8BG67 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms