Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG40

Katnb1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnb1Q8BG40 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms