Protein–RNA interactions for Protein: Q810F0

Prima1, Proline-rich membrane anchor 1, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prima1Q810F0 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prima1Q810F0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms