Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZA4

Pkhd1l1, Fibrocystin-L, mousemouse

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Length 4,249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Pkhd1l1Q80ZA4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Pkhd1l1Q80ZA4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Pkhd1l1Q80ZA4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Pkhd1l1Q80ZA4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Pkhd1l1Q80ZA4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Pkhd1l1Q80ZA4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Pkhd1l1Q80ZA4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Pkhd1l1Q80ZA4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Pkhd1l1Q80ZA4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Pkhd1l1Q80ZA4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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