Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrfn4Q80XU8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrfn4Q80XU8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrfn4Q80XU8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrfn4Q80XU8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrfn4Q80XU8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrfn4Q80XU8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrfn4Q80XU8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrfn4Q80XU8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrfn4Q80XU8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrfn4Q80XU8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrfn4Q80XU8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrfn4Q80XU8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrfn4Q80XU8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrfn4Q80XU8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrfn4Q80XU8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrfn4Q80XU8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrfn4Q80XU8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrfn4Q80XU8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrfn4Q80XU8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrfn4Q80XU8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrfn4Q80XU8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrfn4Q80XU8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrfn4Q80XU8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrfn4Q80XU8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrfn4Q80XU8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrfn4Q80XU8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrfn4Q80XU8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrfn4Q80XU8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrfn4Q80XU8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrfn4Q80XU8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrfn4Q80XU8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrfn4Q80XU8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrfn4Q80XU8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrfn4Q80XU8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrfn4Q80XU8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrfn4Q80XU8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrfn4Q80XU8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrfn4Q80XU8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrfn4Q80XU8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrfn4Q80XU8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrfn4Q80XU8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrfn4Q80XU8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrfn4Q80XU8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrfn4Q80XU8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrfn4Q80XU8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrfn4Q80XU8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrfn4Q80XU8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrfn4Q80XU8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrfn4Q80XU8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrfn4Q80XU8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrfn4Q80XU8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrfn4Q80XU8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrfn4Q80XU8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrfn4Q80XU8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrfn4Q80XU8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrfn4Q80XU8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrfn4Q80XU8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrfn4Q80XU8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrfn4Q80XU8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrfn4Q80XU8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrfn4Q80XU8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrfn4Q80XU8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrfn4Q80XU8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrfn4Q80XU8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrfn4Q80XU8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrfn4Q80XU8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrfn4Q80XU8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrfn4Q80XU8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrfn4Q80XU8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrfn4Q80XU8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrfn4Q80XU8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrfn4Q80XU8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrfn4Q80XU8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrfn4Q80XU8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrfn4Q80XU8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrfn4Q80XU8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrfn4Q80XU8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrfn4Q80XU8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrfn4Q80XU8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrfn4Q80XU8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrfn4Q80XU8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrfn4Q80XU8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrfn4Q80XU8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrfn4Q80XU8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrfn4Q80XU8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrfn4Q80XU8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrfn4Q80XU8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrfn4Q80XU8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrfn4Q80XU8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrfn4Q80XU8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrfn4Q80XU8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrfn4Q80XU8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrfn4Q80XU8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrfn4Q80XU8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrfn4Q80XU8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrfn4Q80XU8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrfn4Q80XU8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrfn4Q80XU8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrfn4Q80XU8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms