Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pja2Q80U04 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pja2Q80U04 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pja2Q80U04 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Pja2Q80U04 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pja2Q80U04 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pja2Q80U04 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pja2Q80U04 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pja2Q80U04 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pja2Q80U04 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pja2Q80U04 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Pja2Q80U04 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pja2Q80U04 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pja2Q80U04 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Pja2Q80U04 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pja2Q80U04 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pja2Q80U04 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pja2Q80U04 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pja2Q80U04 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pja2Q80U04 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pja2Q80U04 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pja2Q80U04 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pja2Q80U04 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pja2Q80U04 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pja2Q80U04 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pja2Q80U04 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pja2Q80U04 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pja2Q80U04 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pja2Q80U04 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pja2Q80U04 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pja2Q80U04 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pja2Q80U04 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pja2Q80U04 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pja2Q80U04 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pja2Q80U04 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pja2Q80U04 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pja2Q80U04 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pja2Q80U04 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pja2Q80U04 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pja2Q80U04 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pja2Q80U04 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pja2Q80U04 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pja2Q80U04 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pja2Q80U04 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pja2Q80U04 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pja2Q80U04 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Pja2Q80U04 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pja2Q80U04 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pja2Q80U04 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pja2Q80U04 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pja2Q80U04 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pja2Q80U04 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pja2Q80U04 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pja2Q80U04 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pja2Q80U04 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pja2Q80U04 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pja2Q80U04 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pja2Q80U04 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Pja2Q80U04 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pja2Q80U04 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Pja2Q80U04 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pja2Q80U04 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Pja2Q80U04 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pja2Q80U04 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pja2Q80U04 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pja2Q80U04 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pja2Q80U04 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pja2Q80U04 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pja2Q80U04 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Pja2Q80U04 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pja2Q80U04 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pja2Q80U04 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pja2Q80U04 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pja2Q80U04 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pja2Q80U04 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pja2Q80U04 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Pja2Q80U04 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pja2Q80U04 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pja2Q80U04 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Pja2Q80U04 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pja2Q80U04 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pja2Q80U04 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pja2Q80U04 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pja2Q80U04 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pja2Q80U04 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pja2Q80U04 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pja2Q80U04 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pja2Q80U04 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pja2Q80U04 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pja2Q80U04 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pja2Q80U04 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pja2Q80U04 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pja2Q80U04 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pja2Q80U04 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Pja2Q80U04 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pja2Q80U04 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pja2Q80U04 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pja2Q80U04 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pja2Q80U04 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pja2Q80U04 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms