Protein–RNA interactions for Protein: Q80TV8

Clasp1, CLIP-associating protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clasp1Q80TV8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Clasp1Q80TV8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Clasp1Q80TV8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Clasp1Q80TV8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Clasp1Q80TV8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Clasp1Q80TV8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Clasp1Q80TV8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Clasp1Q80TV8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Clasp1Q80TV8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Clasp1Q80TV8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Clasp1Q80TV8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Clasp1Q80TV8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Clasp1Q80TV8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Clasp1Q80TV8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Clasp1Q80TV8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Clasp1Q80TV8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Clasp1Q80TV8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Clasp1Q80TV8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Clasp1Q80TV8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Clasp1Q80TV8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Clasp1Q80TV8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Clasp1Q80TV8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Clasp1Q80TV8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Clasp1Q80TV8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Clasp1Q80TV8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Clasp1Q80TV8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Clasp1Q80TV8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Clasp1Q80TV8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Clasp1Q80TV8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Clasp1Q80TV8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Clasp1Q80TV8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Clasp1Q80TV8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Clasp1Q80TV8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Clasp1Q80TV8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Clasp1Q80TV8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Clasp1Q80TV8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Clasp1Q80TV8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Clasp1Q80TV8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Clasp1Q80TV8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Clasp1Q80TV8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Clasp1Q80TV8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Clasp1Q80TV8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Clasp1Q80TV8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Clasp1Q80TV8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Clasp1Q80TV8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Clasp1Q80TV8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Clasp1Q80TV8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Clasp1Q80TV8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Clasp1Q80TV8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Clasp1Q80TV8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Clasp1Q80TV8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Clasp1Q80TV8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Clasp1Q80TV8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
Clasp1Q80TV8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Clasp1Q80TV8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Clasp1Q80TV8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Clasp1Q80TV8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Clasp1Q80TV8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Clasp1Q80TV8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Clasp1Q80TV8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Clasp1Q80TV8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Clasp1Q80TV8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Clasp1Q80TV8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Clasp1Q80TV8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Clasp1Q80TV8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Clasp1Q80TV8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Clasp1Q80TV8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Clasp1Q80TV8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Clasp1Q80TV8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Clasp1Q80TV8 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Clasp1Q80TV8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Clasp1Q80TV8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Clasp1Q80TV8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Clasp1Q80TV8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Clasp1Q80TV8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Clasp1Q80TV8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Clasp1Q80TV8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Clasp1Q80TV8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Clasp1Q80TV8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Clasp1Q80TV8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Clasp1Q80TV8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Clasp1Q80TV8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Clasp1Q80TV8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Clasp1Q80TV8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Clasp1Q80TV8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Clasp1Q80TV8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Clasp1Q80TV8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Clasp1Q80TV8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Clasp1Q80TV8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Clasp1Q80TV8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Clasp1Q80TV8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Clasp1Q80TV8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Clasp1Q80TV8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Clasp1Q80TV8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Clasp1Q80TV8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Clasp1Q80TV8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Clasp1Q80TV8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Clasp1Q80TV8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Clasp1Q80TV8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Clasp1Q80TV8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms