Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT18

Atf7ip, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf7ipQ7TT18 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atf7ipQ7TT18 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atf7ipQ7TT18 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atf7ipQ7TT18 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Atf7ipQ7TT18 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atf7ipQ7TT18 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atf7ipQ7TT18 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atf7ipQ7TT18 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atf7ipQ7TT18 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atf7ipQ7TT18 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atf7ipQ7TT18 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atf7ipQ7TT18 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atf7ipQ7TT18 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atf7ipQ7TT18 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atf7ipQ7TT18 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atf7ipQ7TT18 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atf7ipQ7TT18 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atf7ipQ7TT18 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atf7ipQ7TT18 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atf7ipQ7TT18 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atf7ipQ7TT18 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atf7ipQ7TT18 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atf7ipQ7TT18 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Atf7ipQ7TT18 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Atf7ipQ7TT18 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Atf7ipQ7TT18 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atf7ipQ7TT18 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Atf7ipQ7TT18 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atf7ipQ7TT18 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atf7ipQ7TT18 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atf7ipQ7TT18 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atf7ipQ7TT18 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atf7ipQ7TT18 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Atf7ipQ7TT18 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atf7ipQ7TT18 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atf7ipQ7TT18 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atf7ipQ7TT18 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Atf7ipQ7TT18 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atf7ipQ7TT18 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atf7ipQ7TT18 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atf7ipQ7TT18 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atf7ipQ7TT18 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atf7ipQ7TT18 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atf7ipQ7TT18 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atf7ipQ7TT18 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atf7ipQ7TT18 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atf7ipQ7TT18 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atf7ipQ7TT18 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atf7ipQ7TT18 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atf7ipQ7TT18 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atf7ipQ7TT18 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atf7ipQ7TT18 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Atf7ipQ7TT18 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atf7ipQ7TT18 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atf7ipQ7TT18 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atf7ipQ7TT18 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atf7ipQ7TT18 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atf7ipQ7TT18 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atf7ipQ7TT18 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atf7ipQ7TT18 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atf7ipQ7TT18 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atf7ipQ7TT18 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atf7ipQ7TT18 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atf7ipQ7TT18 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atf7ipQ7TT18 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Atf7ipQ7TT18 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atf7ipQ7TT18 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atf7ipQ7TT18 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atf7ipQ7TT18 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atf7ipQ7TT18 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Atf7ipQ7TT18 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Atf7ipQ7TT18 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atf7ipQ7TT18 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atf7ipQ7TT18 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atf7ipQ7TT18 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atf7ipQ7TT18 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atf7ipQ7TT18 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atf7ipQ7TT18 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atf7ipQ7TT18 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atf7ipQ7TT18 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atf7ipQ7TT18 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atf7ipQ7TT18 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atf7ipQ7TT18 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Atf7ipQ7TT18 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atf7ipQ7TT18 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atf7ipQ7TT18 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atf7ipQ7TT18 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Atf7ipQ7TT18 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atf7ipQ7TT18 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atf7ipQ7TT18 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atf7ipQ7TT18 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Atf7ipQ7TT18 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atf7ipQ7TT18 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atf7ipQ7TT18 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Atf7ipQ7TT18 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atf7ipQ7TT18 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atf7ipQ7TT18 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atf7ipQ7TT18 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atf7ipQ7TT18 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atf7ipQ7TT18 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms