Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms