Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN7

Igsf5, Immunoglobulin superfamily member 5, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf5Q7TSN7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Igsf5Q7TSN7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Igsf5Q7TSN7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Igsf5Q7TSN7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Igsf5Q7TSN7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Igsf5Q7TSN7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Igsf5Q7TSN7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Igsf5Q7TSN7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Igsf5Q7TSN7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Igsf5Q7TSN7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Igsf5Q7TSN7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Igsf5Q7TSN7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Igsf5Q7TSN7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Igsf5Q7TSN7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Igsf5Q7TSN7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Igsf5Q7TSN7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms