Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms